简明生物信息学 作 者: 林昊,郭锋彪,王栋 编出版时间:2014内容简介《简明生物信息学》主要内容包括:基因芯片数据分析、免疫信息学、蛋白质信息学、基因组信息学、密码子与DNA序列信息、序列比对与分子进化等。目录第一章 绪论第一节 基本概念第二节 生物信息学的发展第三节 研究任务第四节 章节安排第二章 序列比对与分子进化第一节 相似性得分系统一、基本概念一、序列的相似性三、序列比对得分矩阵第二节 序列比对方法一、点阵法一、动态规划法三、序列比对工具第三节 数据库搜索一、FASTA一、BLAST_第四节 分子系统发生分析一、分子钟学说与中性进化理论一、进化距离三、系统发生树构建方法第五节 系统发生树构建软件使用一、PHYLIP使用一、MEGA使用第三章 密码子与DNA序列信息第一节 遗传密码的稳定性一、四碱基的DNA序列一、遗传密码的简并规则三、氨基酸的不可替代性第二节 DNA的短程关联和长程关联一、DNA序列的短程关联一、DNA序列的谱分析与长程关联三、DNA序列阅读框架的非均匀性第三节 DNA的数学表示一、DNA序列的混沌图示法一、DNA序列的算术描述第四章 基因组信息学第一节 基因预测一、真核基因预测一、原核基因预测三、病毒基因预测四、元基因组的基因预测五、微生物基因组的重新注释第二节 基因组的组成及结构的分析及预测一、真核生物基因组的GC等值区及CpG岛一、细菌的基因组岛及复制起始位点的预测三、密码子使用策略分析第三节 人类疾病相关基因的识别一、人类疾病相关基因的识别一、致病菌毒力基因与耐药基因的识别三、人类重要疾病数据库第四节 非编码RNA的预测第五节 利用GO注释基因功能第五章 蛋白质信息学第一节 蛋白质数据库一、Uniprot蛋白质序列数据库一、PDB蛋白质结构数据库第二节 蛋白质结构预测一、蛋白质结构一、蛋白质二级结构预测三、蛋白质三级结构预测四、蛋白质结构相关预测第三节 蛋白质功能预测……第六章 基因芯片数据分析第七章 免疫信息学 上一篇: 临床病理解剖学 第3版 下一篇: 生命之窗·生命科学前沿纵览 细胞生物学