CRISPR-Cas-RNA介导的细菌和古细菌中适应性免疫系统
作者：（美）鲁道夫·巴兰古，（荷）约翰·范德奥斯特 主编
出版时间：2018年版
内容简介
　　CRISPR-Cas是最近发现的一种适应性免疫防御系统，这个系统保护近半细菌和绝大部分古细菌免受可移动遗传因子（病毒和质粒）的侵袭。在至少一半的现有原核生物基因组中已经鉴定出一系列不同的CRISPR-Cas免疫系统。尽管仍然存在许多谜团有待揭示，但当前进行的生物化学功能分析为我们提供了这些令人着迷系统的功能，并在某些可能应用方面有了一定的深刻认识。 在本书中，行业内的专家们对这个令人振奋的新领域的现状和发展趋势做了概要性阐述。
目录
序
原著前言
第1章 CRISPR的发现和重要发展
1.1 概述
1.2 早期突破
1.2.1 规律间隔重复序列
1.2.2 分枝杆菌中的同向重复序列
1.2.3 嗜盐古菌中的TREPs
1.2.4 原核微生物重复序列新家族
1.2.5 古细菌和细菌中CRISPR序列的分布
1.2.6 加工的CRISPR转录物的发现
1.2.7 CRISPR相关蛋白的鉴定
1.3 CRISPR-Cas系统的功能
1.3.1 早期假设
1.3.2 CRISPR与入侵遗传元件的关系
1.3.3 CRISPR系统的功能多样性
1.4 基于CRISPR系统的功能元件
1.4.1 CRISPR相关蛋白（Cas）
1.4.2 CRISPR序列
1.4.3 前导区
1.4.4 重复序列
1.4.5 间隔序列
1.4.6 前间隔区毗邻基序
1.4.7 CRISPRRNAs
1.5 反馈
第2章 CRISPR-Cas系统的形成、多样性和基因分型意义
2.1 概述
2.2 评估CRISPRs的整体多样性
2.2.1 生物信息学工具
2.2.2 在已公布的基因组中发现的CRISPRs多样性
2.3 CRISPRs多态性用于基因分型的历史案例
2.3.1 为什么需要以及如何进行种内分型
2.3.2 种内CRISPR变异
2.3.3 复杂微生物组中CRISPR多样性的后续研究
2.4 讨论
第3章 CRISPR-Cas系统的进化与分类和Cas蛋白家族
3.1 概述
3.2 CRISPR-Cas系统的分类
3.3 Cas蛋白家族
3.3.1 Cas 1和Cas 2：在间隔区获得中发挥作用的Cas特征蛋白
3.3.2 HD结构域：干扰所需的单链特异性DNAse
3.3.3 级联相关性蛋白
3.3.4 RAMPs的三大家族
3.3.5 CRISPR-Cas操纵子中RAMP基因的特征性排列
3.3.6 各种Ⅰ型和Ⅲ型CRISPR-Cas系统的大小亚基之间推测的同源性
3.3.7 Ⅱ型CRISPR-Cas系统和Cas9同源物
3.3.8 关于CRISPR-Cas系统起源和进化的假设
3.3.9 结论
第4章 基于CRISPR的免疫应答调控
第5章 crRNA的生物合成





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